除达赖和班禅两大活佛外，一些大的寺院也实行活佛转世制度。藏传佛教认为活佛是永恒的，通过连续不断的“转世”来到世间生活。因此一位活佛圆寂时，就要根据种种“征兆”和“启示”，来确定活佛转世的方向和地点，然后再派人沿着一定方向寻找被认为是活佛化身的“转世灵童”。有时找来的“灵童”不止-个，会出现纠纷和争执，因此清乾隆皇帝于乾隆五十七年(1792)特颁发两个金瓶，一置北京雍和宫，一置拉萨大昭寺。凡在理藩院注册的藏传佛教蒙、藏大活佛，如章嘉呼图克图、哲布尊丹巴、达赖、班禅等转世时，均须将寻得的若干“灵童”的名字写在象牙签上，置于金瓶中，由理藩院尚书在雍和宫或由驻藏大臣在大昭寺监督掣签来确定“灵童”，然后经过“坐床”仪式，便正式成为“转世活佛”。 藏传佛教格鲁派有两大活佛转世系统，一个是达赖喇嘛，另一个为班禅额尔德尼。转世系统虽然不同，但达赖和班禅的宗教政治地位是平等的。达赖与班禅个人之间互为师徒，关系颇为密切。班禅方面：一世班禅为一世达赖之师；四世班禅为四世、五世达赖之师；五世班禅为六世、七世达赖之师；六世班禅为八世达赖之师；七世班禅为九世、十世、十一世达赖之师；八世班禅为十三世达赖之师。达赖方面：五世达赖为五世班禅之师；七世达赖为六世班禅之师；八世达赖为七世班禅之师；十三世达赖为九世班禅之师。 1933年12月17日，十三世达赖圆寂。1938年冬，在青海寻访到“灵童”，被认为是达赖转世的化身。1939年3月，国民党政府派蒙藏委员会委员长吴忠信入藏。1940年2月22日，十四世达赖在布达拉宫举行了继承职位的仪式“坐床典礼”。

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　　据说，寻觅灵童，主要遵照以下三点精神： ①十三世达赖圆寂时，面向东，暗示将转生东方； ②乃穹(护法神)降神说达赖将转生东北汉人地方； ②热振(大活佛之一，地位仅次于达赖、班禅)观海。海内现一农家，位马路将尽处，门前巨柳一株，旁系白马，有妇人抱小儿立树下。热振将海中所现情景，请画师详细绘出，并派格桑活佛及古桑子二人，按图向东北方向寻访，费时二年之久。果然在青海寻获灵童家庭，当时的情景与热振观海所见的完全相同。于是，古桑子伪装阔商，格桑活佛扮作仆从，共至灵童家借宿。灵童对阔客竞不理采，而对“仆从”格桑活佛却表示好感，与他亲近，抚其面捋其须，并将其项间所挂念珠一串摘下说：“这是我的东西，现应归还我！”格桑活佛是十三世达赖亲近侍从，念珠确为达赖所赐。接着格桑等复出茶杯十多只，其中新旧参差，色泽亦不一致，让灵童自选，灵童不取其中最大最美的，而择一淡黄色旧杯，也是十三世达赖旧物。如此反复试验，无不应验，于是确认其为达赖化身。

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　　1939年7月，灵童自西乡启程，10月初抵藏。抵拉萨后，西藏僧俗欢喜若狂，入城之日，远道来此赡礼者，逾数万人。后抵罗布林卡，受西藏官民公开朝拜。参拜时，或献五供，或献布帛，或献金钱，均由专司喇嘛接收。灵童高坐上位。总堪布旁立侍应。拜者献物后，即趋至灵童座前，以头就供桌，灵童或摩之以手，或举拂尘略拭其发，或竟置之不理；受摩顶者庆幸可以超脱苦海；被忽略者，惟自恨轮回未尽。参拜后，藏民退出，藏官则围坐殿内，由喇嘛二人，各以巨壶盛酥油茶，以巨罐盛米饭，分给在座者。藏官均于怀中取出木碗，接茶少许，尽力饮之；饭则用于抓食。据说此为佛赐，食之可以长生。 1940年2月22日，吴忠信委员长主持灵童坐床典礼。灵童升座后，热振起立向他行三叩首礼，司伦及三噶伦亦继热振起立，向灵童叩首。经过诵经等程序后，给灵童戴上一尖顶黄缎僧帽，表示加冕之意。从此以后，灵童便可正式称达赖。 小达赖渐渐长大，在专职经师的教育下学经习礼。学经的生涯是辛苦的，他每日的功课是研究显、密两宗教义，搞清各世活佛及佛教的历史，背诵经文。

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　　十大呼图克图，是格鲁派内有“国王化身”之称的大活佛，地位仅次干达赖、班禅，在达赖年幼时，有资格出任摄政王等高官。 藏传佛教的活佛转世制度，是藏传佛教有别于其他宗教和佛教其他支派的最为独特的方面之一。活佛转世的空没、玄妙，增加了藏传佛教的神秘色彩。 按照佛教教义的说法，一个活佛的圆寂，不过是灵魂的转移，化身为另一肉体的人而已。化身随机体显现，所以必有灵童转世。 活佛生生不息地沿袭下来，是由转世制度维系的。世世相接，永垂无疆。活佛转世制度创立于公元十三世纪。最早起源于噶举派中的噶玛噶举派。噶举派注重隐居生活，注意修行。西康僧人都松钦巴对噶举派学说有独到的见解，并建立了自己的寺院广授学徒创立一派一噶玛噶举派黑帽系。公元1333年，噶举派黑帽系第三代主持——让迥多吉受到元帝国皇室的邀请，赴京参加了元顺帝的登基典礼，受到了元朝青睐，取代了萨迦派的地位。当他第三次上京访问时，不幸染病圆寂，临终前留有遗言，说自己将在西藏的工布地方转世。他的弟子在他圆寂后，根据多种迹象和征兆，在工布寻访确认了他的转世，成为第四代主持。 从此，活佛转世制度开始出现。藏传佛教各派竞相仿效。 十五世纪后，在藏区具有广泛影响的格鲁派（黄教）的活佛转世制度，就是效仿噶玛噶举派的黑帽系所采用的转世制度。

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　　活佛的佛位，有高低大小之分。藏传佛鹏达赖喇嘛和班禅喇嘛为最高活佛。 达赖，蒙古语意为大海。喇嘛，藏语意为上人或上师。明嘉靖二十一年（1542），格鲁派采用活佛转世制度，迎请黄教（格鲁派）创始人宗喀巴的后世弟子索南嘉措到哲蚌寺继任寺主职位。习惯上，一般把四岁的索南嘉措进入哲蚌寺的时间作为格鲁派寺院集团形成的标志。明万历六年（1578），蒙古土默特部顺义王俺达汗（也有译为“阿拉坦”）迎请索南嘉措到青海传教，甚为尊奉。两人在青海湖东仰华寺会面，互赠尊号。俺达汗赠索南嘉措以“圣识一切瓦齐尔达喇达赖喇嘛”称号，这句由蒙语、藏语、汉语多种语言组成的尊号，意思是“超凡入圣”、学问渊博犹如大海一般的大师”。这是达赖名号的来历。后来格鲁派僧众以索南嘉措为三世达赖，上溯其师承，以根敦嘉措为二世，以宗喀巴的上首弟子根敦主为一世。

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